COVID-19病症的体现可以从泌尿道携带、轻症到需要呼吸机甚至胃上皮细胞肺氧合(ECMO)维系生命的危病患病患,这其之前的关键极为重要因素仍然有待解码。同时,新型冠状菌株是不是在传递步骤之前起因明显的基因基因突变,导致菌株毒力和传染性的发生变化,也急需进一步研究工作。
自SARS爆发之后,复旦大学附属南京市卫生药理学一个之前心(请注意简称公卫一个之前心)与转化医学发达国家重大科技配套(南京)(请注意简称军事设施)、南京流行病学研究工作组、医学遗传物质学发达国家之前长期的实验室、瑞金医院药理学菌株学的实验室,复旦大学南京学院分子菌株的实验室、南京交通大学学院附属同仁医院、之前科院豆科植物生理自然环境研究工作组、南京巴斯德研究工作组和南京营养与健康研究工作组等单位通力合作,就新型冠状菌株遗传物质、分子流行病学特点、病症药理学特质透过了深入研究工作。
5月20日,《Nature》杂志发表了这一团队的同类型研究工作结果。具体来说,公卫生一个之前心卢洪洲教授与军事设施主任陈赛娟院士领衔的联合攻关团队,收集了公卫一个之前心在2020年1月20日-2月25日期间医护核心技术人员的326可有病患骨骼,对菌株遗传物质反转、药理学体现特点和免疫反应发生变化等数据透过了全盘深度数据分析。
研究工作团队不断完善核心技术方法,高质量完成了112可有新冠菌株遗传物质高通量、组装和解析。他们基于菌株遗传物质脱氧核糖核酸的进化树数据分析注意到,新冠菌株主要有两个分支(Clade I 和Clade II)。已证实有华南水果市场接触世界史的6可有病患均集之前在其之前一个分枝之前(Clade I),而Clade II病患无该接触世界史,示意COVID-19SARS的起因并不以外华南水果市场。
新冠菌株遗传物质进化树
接着,通过对SARS暴发的相同时间阶段和相同区域病患的新冠菌株基因脱氧核糖核酸(截至2020年3月末)反转特质的相对数据分析,从南京病症裂解的菌株遗传物质之前识别了169个碱基发生变化,其重复出现的基因突变与已公布的菌株脱氧核糖核酸一致,呈现较为稳定的进化步骤,示意该菌株可能在SARS早期就已适应在人类宿主之前传递。同时他们注意到, 新冠菌株两个分支的传递性、致病性和药理学体现等方面无突出差异,未注意到与COVID-19病患病患有突出就其的菌株反转脱氧核糖核酸。
COVID-19病症淋巴细胞变化
研究工作核心技术人员从药理学和生物医学研究工作注意到,COVID-19病患淋巴细胞明显减少,尤其是病患病患CD4+和CD8+ T细胞呈突出透过性上升趋向,且炎性诱导IL-6和IL-8明显上升。COVID-19病症发展不堪重负程度的直接影响主要与病患年龄、基础病症及淋巴细胞减少和就其的诱导百慕大密切就其,为病症向病患转变的关键橙色因子。
这一研究工作结果含意深远,对于进一步认清新型冠状菌株的分子流行病特质、病症起因发展适应性,为病患病症早期诊断和治疗,以及为药物和疫苗共同开发提供了重要的参看依据。
此外,研究工作团队还向之前国发达国家组学数据百科全书(The National Omics Data Encyclopedia,NODE) ()、全球流感脱氧核糖核酸数据源(GISAID)和NCBI的国际脱氧核糖核酸数据源(SRA)寄出了112个病症的新冠菌株遗传物质高质量脱氧核糖核酸数据。同时,军事设施也搭建了重大病症大数据网络服务新冠菌株遗传物质数据交互式、开源在线数据分析网站()。国际间科研单位和科学研究均可完全共享就其研究工作数据。
原始出处:
Xiaonan Zhang, Yun Tan, Yun Ling, et.al. Viral and host factors related to the clinical outcome of COVID-19. Nature 20 May 2020
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